近期,中國科學院分子植物科學卓越創新中心的韓斌院士團隊取得了水稻基因組研究領域的重大突破。該團隊成功完成了對145份亞洲栽培稻及其普通野生稻的高精度基因組組裝,繪制出了一張前所未有的“野生稻-栽培稻泛基因組圖譜”。
這項研究不僅深入挖掘了普通野生稻豐富的遺傳多樣性,還全面揭示了亞洲栽培稻各類群的進化及馴化路徑。通過這一圖譜,科學家們得以窺見野生稻歷經萬年演化所積累的“生存智慧”,這對于應對全球人口增長和氣候變化帶來的糧食安全挑戰具有重要意義。
然而,傳統的研究模式主要依賴于單一的參考基因組,這限制了科學家們對水稻遺傳多樣性的全面理解。韓斌院士團隊通過整合129份普通野生稻和16份亞洲栽培稻資源,進行了高質量的基因組測序和從頭組裝,成功構建了一個覆蓋野生稻和栽培稻全面遺傳景觀的泛基因組圖譜。
這一圖譜為科學家們提供了一個前所未有的資源,使他們能夠深入挖掘野生稻中的耐逆、抗病等優良性狀的遺傳變異。研究發現,野生稻中的抗病基因豐度和多樣性均明顯高于栽培稻,已精確定位到多個抗病基因位點,其中包括已驗證的抗稻瘟病基因。
研究團隊還對亞洲栽培稻的早期關鍵馴化基因進行了單倍型分析,進一步證實了亞洲栽培稻單起源假說,并為持續數十年的學術爭議提供了關鍵證據。同時,他們還發現了南亞各栽培稻類群之間存在廣泛的基因交流,并定義了一個新的栽培稻亞群。
這一研究成果不僅構建了一個近飽和的野生稻泛基因組數據庫,實現了野生稻遺傳資源的系統性整合,還有效彌合了野生稻和栽培稻基因組學研究的差距。科學家們可以據此精準挖掘野生稻中的優勢等位基因,追溯重要基因的起源,并解析水稻的環境適應性和表型可塑性機制。
在糧食安全日益成為全球關注焦點的今天,這項研究為實現水稻的快速從頭馴化和精準培育抗逆性強、資源利用率高、產量突破的新品種提供了關鍵的基因資源。《自然》雜志同期發布的研究簡報也強調了該研究在未來保障糧食安全方面的重大意義。